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연구는 인류 대 외계인의 경합에서 결정적인 요소이다. X-COM 부대는 외계인 적들에 비해 훨씬 낙후되어 있지만, 외계 인의 기술을 터득해 가면서, 전투의 향방은 인간 쪽으로 돌아서게 된다.
연구를 통해, X-COM 부대는 대폭 향상된 무기 기술, 갑옷, 기지 설비, 요격 및 수송 항공기, 그 외 유용한 기술들을 많이 획득하게 된다. 생포한 외계인을 연구하면 외계인의 수법과 특성에 대한 정보를 얻을 수 있고, 궁극적으로 게임 승리로 가는 유일한 길이다.
연구에 대한 자세한 내용은 다음 페이지들을 보라.